瑞安火车站位于飞云镇吴桥村,该站分为两层,旅客采用“上进下出”的形式进出站。甬台温、温福铁路首批开行的13对上海、杭州至温州南、福州等方向动车组列车车次、到发时间、沿途停站已全部敲定,并于2009年9月28日开通试运营。